121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0328 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0328  protein of unknown function DUF423  100 
 
 		 159 aa  316  7e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.858167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3902  hypothetical protein  44.76 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4914  protein of unknown function DUF423  45.39 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0895  protein of unknown function DUF423  46.28 
 
 		 120 aa  100  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0606  hypothetical protein  40.71 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0620  hypothetical protein  40.71 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0230  hypothetical protein  40.58 
 
 		 123 aa  97.4  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2499  hypothetical protein  47.55 
 
 		 128 aa  97.4  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300029  decreased coverage  0.000130725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  44.68 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0432  hypothetical protein  41.73 
 
 		 126 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4742  hypothetical protein  43.17 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2261  protein of unknown function DUF423  46.67 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.328273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0359  hypothetical protein  41.73 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3413  hypothetical protein  42.55 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0331  protein of unknown function DUF423  39.13 
 
 		 125 aa  90.5  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.120447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0152  hypothetical protein  39.13 
 
 		 127 aa  90.5  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04960  hypothetical protein  41.67 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5332  hypothetical protein  40.41 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.423162  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5156  hypothetical protein  41.01 
 
 		 123 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444342  normal  0.879938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0637  protein of unknown function DUF423  37.76 
 
 		 125 aa  87.8  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  40.29 
 
 		 123 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  40.29 
 
 		 123 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2013  protein of unknown function DUF423  37.78 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0478  hypothetical protein  40.28 
 
 		 125 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324677  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1031  hypothetical protein  39.72 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0440942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4468  hypothetical protein  35.51 
 
 		 129 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3913  hypothetical protein  38.41 
 
 		 122 aa  86.3  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5243  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5642  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2762  hypothetical protein  36.91 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.340098  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2407  hypothetical protein  39.42 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5073  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000730403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5185  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5090  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2982  hypothetical protein  37.41 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5571  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5515  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5436  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5487  hypothetical protein  36.96 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5521  hypothetical protein  36.23 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2662  hypothetical protein  34.97 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3469  hypothetical protein  35.76 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0108117  hitchhiker  0.000383928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6267  protein of unknown function DUF423  39.58 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015945  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2563  hypothetical protein  35.66 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3505  hypothetical protein  39.44 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.248867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0402  hypothetical protein  51.06 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.151461  hitchhiker  0.000250509 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  33.56 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2079  hypothetical protein  37.31 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004250  hypothetical protein  34.44 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000539124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3368  protein of unknown function DUF423  36.17 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00388391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3477  protein of unknown function DUF423  40.28 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3320  hypothetical protein  35.57 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00120689  normal  0.931239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1117  protein of unknown function DUF423  46.43 
 
 		 125 aa  77  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206789  normal  0.818653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4023  hypothetical protein  49 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.343948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01185  hypothetical protein  34.44 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2781  hypothetical protein  34.65 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02564  uncharacterized small membrane protein  37.23 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00480554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1366  hypothetical protein  45.98 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0307163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1284  hypothetical protein  34.97 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00814173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1352  hypothetical protein  45.98 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.679146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1391  hypothetical protein  45.98 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.129642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2994  protein of unknown function DUF423  45.98 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103925  hitchhiker  0.00000155548 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3149  hypothetical protein  38.06 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4139  protein of unknown function DUF423  50 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02658  conserved inner membrane protein  34.84 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0881  protein of unknown function DUF423  34.84 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02619  hypothetical protein  34.84 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2951  hypothetical protein  34.84 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.01255e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3113  hypothetical protein  34.84 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0905  hypothetical protein  34.84 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2948  hypothetical protein  34.84 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000825789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3063  hypothetical protein  34.84 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.47901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4071  hypothetical protein  34.84 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000289179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2201  hypothetical protein  33.81 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4165  protein of unknown function DUF423  49 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.385275  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3206  hypothetical protein  32.9 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3191  hypothetical protein  32.9 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0186134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3143  hypothetical protein  32.9 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00090815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3126  hypothetical protein  32.9 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000001734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3306  hypothetical protein  32.9 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0654782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1612  membrane protein DUF423  31.3 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221104  normal  0.524793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0928  hypothetical protein  32.45 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0698  hypothetical protein  36.81 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2793  hypothetical protein  37.29 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00315578  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3253  hypothetical protein  32.9 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.222088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0419  hypothetical protein  36.09 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000652034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02960  hypothetical protein  35.77 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2892  hypothetical protein  37.29 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000389686  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1535  hypothetical protein  35.16 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2722  hypothetical protein  36.44 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000162987  normal  0.0799022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2993  hypothetical protein  31.13 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0621  protein of unknown function DUF423  38.46 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3593  hypothetical protein  39.58 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000700464  normal  0.124416 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0764  hypothetical protein  35.77 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2427  hypothetical protein  39.29 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  38.71 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1603  hypothetical protein  37.6 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3804  hypothetical protein  38.71 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00311639  unclonable  0.0000000190492 
 
 
-
 
NC_006686  CND04220  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3177  hypothetical protein  34.31 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>