34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1900 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1900  transposase  100 
 
 		 72 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  86.11 
 
 		 553 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  86.11 
 
 		 553 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  86.11 
 
 		 553 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  86.11 
 
 		 553 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  86.11 
 
 		 553 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  79.17 
 
 		 559 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  87.5 
 
 		 352 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3240  hypothetical protein  75 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  59.15 
 
 		 569 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  59.15 
 
 		 551 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  59.15 
 
 		 551 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  54.93 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  52.38 
 
 		 559 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  52.78 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  56.67 
 
 		 442 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  55.74 
 
 		 554 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  55 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  55 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  54.24 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  47.54 
 
 		 566 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  47.54 
 
 		 566 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  47.54 
 
 		 566 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  43.06 
 
 		 559 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  43.06 
 
 		 594 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  43.66 
 
 		 558 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  43.66 
 
 		 558 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  42.25 
 
 		 360 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3053  hypothetical protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  36.67 
 
 		 585 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  36.67 
 
 		 585 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  36.67 
 
 		 585 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  36.67 
 
 		 585 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  36.67 
 
 		 585 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>