32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0500 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0500  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1260  hypothetical protein  92.95 
 
 		 310 aa  591  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0186  hypothetical protein  88.31 
 
 		 312 aa  567  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0240  hypothetical protein  88.64 
 
 		 312 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1311  hypothetical protein  81.97 
 
 		 303 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.549363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3881  hypothetical protein  77.89 
 
 		 325 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2690  hypothetical protein  75.08 
 
 		 305 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0442  hypothetical protein  73.29 
 
 		 311 aa  478  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2068  hypothetical protein  73.31 
 
 		 311 aa  478  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0877  hypothetical protein  68.71 
 
 		 294 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0928  hypothetical protein  70.24 
 
 		 289 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0925  hypothetical protein  69.9 
 
 		 289 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0675759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3223  hypothetical protein  68.17 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.226821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  62.93 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.98 
 
 		 684 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.98 
 
 		 685 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 		 669 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 		 672 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 		 672 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 680 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  30 
 
 		 604 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  28.75 
 
 		 534 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  27.5 
 
 		 602 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  24.55 
 
 		 1276 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  24.88 
 
 		 415 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  26.46 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  27.33 
 
 		 803 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  24.32 
 
 		 326 aa  46.2  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4248  hypothetical protein  25.63 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0450926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  27.56 
 
 		 801 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  22.44 
 
 		 460 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  23.61 
 
 		 662 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>