More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1390 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  100 
 
 
235 aa  474  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  45.87 
 
 
226 aa  216  2e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  50.92 
 
 
201 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.91 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2353  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 
233 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  44.58 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  41.98 
 
 
248 aa  193  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  44.63 
 
 
248 aa  193  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.45 
 
 
249 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  43.93 
 
 
247 aa  189  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  46.95 
 
 
207 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  46.26 
 
 
207 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  44 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  44 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  44 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  40.91 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  44 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  41.25 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  44 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  44 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  44 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  44 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  43.62 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  43.6 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  44.7 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  43.6 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  42.8 
 
 
250 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  40.33 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  41.98 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  40.08 
 
 
234 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  40.74 
 
 
249 aa  181  9.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  41.15 
 
 
251 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  44 
 
 
250 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  42.39 
 
 
248 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  45.07 
 
 
207 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  40.57 
 
 
245 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  42.8 
 
 
250 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  42.39 
 
 
250 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  42.8 
 
 
250 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  42.8 
 
 
250 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  42.8 
 
 
250 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  40.42 
 
 
245 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1395  phosphoglycerate mutase 1  41.84 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0143791  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  40.89 
 
 
251 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  39.92 
 
 
245 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  40.16 
 
 
293 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  41.39 
 
 
228 aa  179  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  40.42 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  41.56 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  41.56 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  41.56 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  41.56 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  41.56 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  41.56 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  41.56 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  42.5 
 
 
246 aa  178  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  44.6 
 
 
208 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  40.33 
 
 
247 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  41.25 
 
 
282 aa  177  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  39.92 
 
 
245 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  38.91 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  42.8 
 
 
250 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  43.15 
 
 
229 aa  176  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  42.4 
 
 
250 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 
247 aa  176  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  43.19 
 
 
208 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  39.26 
 
 
306 aa  176  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  40.33 
 
 
245 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  40.33 
 
 
245 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  44.13 
 
 
206 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  42.39 
 
 
270 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  40.74 
 
 
249 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1523  phosphoglycerate mutase 1 family  41.56 
 
 
247 aa  175  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  41.08 
 
 
227 aa  176  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  39.2 
 
 
237 aa  176  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  40.74 
 
 
249 aa  176  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  40.83 
 
 
250 aa  175  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  39.09 
 
 
248 aa  175  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  40.33 
 
 
247 aa  175  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  37.84 
 
 
230 aa  175  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  40.08 
 
 
247 aa  175  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  40.74 
 
 
247 aa  175  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  41.98 
 
 
270 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  41.98 
 
 
248 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  41.56 
 
 
247 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  39.09 
 
 
250 aa  175  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  43.93 
 
 
212 aa  174  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  39.51 
 
 
247 aa  174  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  39.67 
 
 
247 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  39.09 
 
 
247 aa  174  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  41.08 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  41.56 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  39.92 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  41.6 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  40.25 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  43.06 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  42.25 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>