27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1389 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1389  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  897    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1400  regulatory protein MarR  62.58 
 
 
452 aa  557  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  62 
 
 
453 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1236  regulatory protein, MarR  62.44 
 
 
453 aa  542  1e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0822  hypothetical protein  34.78 
 
 
529 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1134  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0464  hypothetical protein  42.86 
 
 
465 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00621297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2512  membrane protein  43.55 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1080  hypothetical protein  34.67 
 
 
207 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3289  hypothetical protein  40.91 
 
 
261 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1681  transcriptional regulator, TrmB  35.62 
 
 
215 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1547  hypothetical protein  28 
 
 
206 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0292935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1142  hypothetical protein  38.03 
 
 
216 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  40.58 
 
 
181 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1819  hypothetical protein  40.28 
 
 
202 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0671776  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1340  regulatory protein MarR  39.66 
 
 
299 aa  47.4  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00576351  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0365  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  46.6  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1896  hypothetical protein  44.44 
 
 
330 aa  46.6  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  39.24 
 
 
640 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1271  hypothetical protein  39.06 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.486206 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1085  hypothetical protein  36.11 
 
 
290 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3002  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  37.66 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  22.22 
 
 
548 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  29.49 
 
 
420 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2531  hypothetical protein  40.62 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000779725  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1381  hypothetical protein  38.1 
 
 
434 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  31.34 
 
 
439 aa  43.1  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>