39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4231 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  59.69 
 
 		 741 aa  819    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  58.38 
 
 		 724 aa  821    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  58.38 
 
 		 724 aa  821    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  100 
 
 		 717 aa  1458    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  58.38 
 
 		 724 aa  821    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  46.51 
 
 		 721 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  45.3 
 
 		 713 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  43.89 
 
 		 714 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  35.34 
 
 		 645 aa  220  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0168  hypothetical protein  28.53 
 
 		 693 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4886  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 707 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.717526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2815  phage integrase family protein  28.2 
 
 		 709 aa  143  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.952182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2253  hypothetical protein  26.14 
 
 		 714 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4579  hypothetical protein  31.9 
 
 		 731 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5289  hypothetical protein  31.9 
 
 		 731 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2616  integrase family protein  29.2 
 
 		 572 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 624 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 624 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  25.41 
 
 		 624 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 624 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  25.41 
 
 		 624 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  25.41 
 
 		 624 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  24.37 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  23.98 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6007  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5427  hypothetical protein  35.71 
 
 		 104 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.642999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  22.83 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  24.8 
 
 		 600 aa  56.6  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  24.8 
 
 		 600 aa  56.6  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5426  hypothetical protein  33 
 
 		 100 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.705268 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6008  hypothetical protein  33 
 
 		 100 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  26.5 
 
 		 683 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  27.36 
 
 		 683 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  23.31 
 
 		 533 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6207  Phage integrase  24.44 
 
 		 475 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00539  hypothetical protein  27.66 
 
 		 475 aa  50.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  24.14 
 
 		 682 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  25.58 
 
 		 707 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 568 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>