282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2754 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  100 
 
 		 391 aa  790    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  37.33 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.86 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  34.86 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.86 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.86 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.62 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  34.58 
 
 		 422 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.62 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.62 
 
 		 373 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  39.24 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  34.18 
 
 		 397 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  39.02 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  36.6 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  35.16 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  35.32 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  33.51 
 
 		 406 aa  212  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  35.12 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  34.55 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  34.56 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  36.52 
 
 		 410 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  35.39 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  33.98 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  35.25 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  36.77 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  35.95 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  35.68 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  35.32 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  35.63 
 
 		 392 aa  203  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  35.68 
 
 		 417 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  33.51 
 
 		 404 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  33.51 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  31.78 
 
 		 390 aa  192  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  31.78 
 
 		 397 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  33.68 
 
 		 402 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  34.79 
 
 		 440 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  33.08 
 
 		 403 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  32.12 
 
 		 363 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  32.63 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  33.16 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  31.81 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  34.84 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  33.66 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  34.57 
 
 		 378 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  34.9 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  35.43 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  35.38 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  36.81 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  30.33 
 
 		 410 aa  170  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  29.64 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  34.26 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  30.27 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  30.83 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  29.97 
 
 		 406 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.46 
 
 		 375 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  27.2 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  27.95 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.86 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.86 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  26.48 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.62 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  26.48 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  26.48 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.48 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  26.48 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.25 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  29.1 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  28.27 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  30.41 
 
 		 360 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.53 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  25.21 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  27.12 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  28.35 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  26.48 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  28.28 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  26.17 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.41 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.41 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.65 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.91 
 
 		 317 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  24.74 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  27.54 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  23.83 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  23.42 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.42 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.42 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.42 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>