More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2912 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2912  ribosomal protein S12  100 
 
 		 137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000187241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2624  30S ribosomal protein S12  93.6 
 
 		 138 aa  241  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000552514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1873  30S ribosomal protein S12  85.95 
 
 		 136 aa  213  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.474423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  74.81 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  68.92 
 
 		 146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2823  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  197  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0494947 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  195  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  73.39 
 
 		 202 aa  194  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  193  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  193  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  193  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1800  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  193  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278795  normal  0.143842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  193  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2962  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  193  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1238  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  192  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  192  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1201  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  192  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.449722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  192  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1951  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000165732  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 135 aa  192  1e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  72.06 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1327  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139307  normal  0.0632073 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  73.64 
 
 		 137 aa  191  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0981  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.808535  normal  0.0659851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1425  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469141  normal  0.0235591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  77.69 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  191  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1674  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  hitchhiker  0.0029615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  73.81 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  191  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 125 aa  191  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5119  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0801  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.208097  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  75.61 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 137 aa  191  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  191  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 122 aa  190  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 126 aa  190  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  73.44 
 
 		 135 aa  190  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  190  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  190  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  190  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 142 aa  189  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  190  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0661  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  189  7e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291952  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0693  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  189  7e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000127901  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 124 aa  189  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 125 aa  189  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000378884  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  189  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  75.4 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  73.02 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  68.92 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0575  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.962051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>