27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1990 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  952    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1988  hypothetical protein  98.36 
 
 		 77 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  37.27 
 
 		 1188 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  45.93 
 
 		 14609 aa  87.4  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  36.89 
 
 		 1831 aa  74.7  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  46.34 
 
 		 1316 aa  67  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  36.22 
 
 		 1394 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3363  hypothetical protein  46.91 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  43.48 
 
 		 3822 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  35.63 
 
 		 830 aa  61.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  31.77 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3362  hypothetical protein  31.49 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  41.3 
 
 		 3861 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  40.59 
 
 		 4009 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  38.18 
 
 		 4357 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  42.19 
 
 		 496 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  37.98 
 
 		 1487 aa  53.9  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  42.68 
 
 		 1107 aa  53.5  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1908 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  50.91 
 
 		 3027 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  43.16 
 
 		 767 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  39.6 
 
 		 866 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  39.6 
 
 		 4022 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  42.05 
 
 		 3907 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 1446 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3625  hypothetical protein  45.45 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000590004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>