More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1890 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  66.42 
 
 		 268 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  63.67 
 
 		 268 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  62.59 
 
 		 271 aa  348  4e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  64.04 
 
 		 268 aa  346  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  64.66 
 
 		 268 aa  341  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  53.41 
 
 		 273 aa  271  6e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  44.53 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.62 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.44 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.68 
 
 		 270 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  43.33 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.3 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.44 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  44.73 
 
 		 258 aa  208  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.3 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.67 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.68 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  40.3 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.19 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.19 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.62 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.25 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.31 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  37.88 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.34 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.34 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.34 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  34.72 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.47 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.21 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  32.08 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  30.2 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  34.95 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  28.8 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  25.29 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  35.58 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  37.14 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  37.14 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  37.14 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  37.14 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  27.07 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  26.56 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  33.98 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  34.62 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  35.24 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  35.24 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2110  uridylate kinase  34.29 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  27.07 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01375  uridylate kinase  33.65 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00470454  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  33.33 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  34.29 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  34.62 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  34.62 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  35.58 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  33.01 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  33.33 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  34.95 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  36.79 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  33.98 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  34.62 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1849  uridylate kinase  33.01 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  33.98 
 
 		 241 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03235  uridylate kinase  33.33 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  33.98 
 
 		 241 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  30.1 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  34.95 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  35.51 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  33.33 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  33.33 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  34.29 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  32.38 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  33.98 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  25.4 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  33.33 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002748  uridylate kinase  33.01 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000503391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  33.33 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  31.43 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  34.95 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2425  uridylate kinase  33.33 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000236228  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  33.33 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  31.43 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  33.33 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  33.01 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  31.43 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  33.01 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  33.65 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23590  uridylate kinase  34.26 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.192648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  32.04 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  33.01 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  32.69 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  32.71 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  33.01 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  35.24 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  24.9 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  33.01 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  33.01 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  36.54 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  33.65 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  33.33 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>