29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1828 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  286  6e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.94 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  31.16 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.5 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.29 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.79 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.74 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  28.99 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  32.85 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.43 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.95 
 
 		 345 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 		 206 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  32.09 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  26.43 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.46 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  23.94 
 
 		 228 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.21 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.12 
 
 		 346 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  26.62 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  29.08 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00370  hypothetical protein  30.25 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.284993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1764  hypothetical protein  25.42 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4195  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.26 
 
 		 190 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  28.57 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.97 
 
 		 187 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.56 
 
 		 188 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  27.56 
 
 		 188 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>