39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1027 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1027  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 123 aa  246  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2575  hypothetical protein  90.24 
 
 		 123 aa  203  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0843755  normal  0.521427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.73 
 
 		 517 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  43.04 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2316  hypothetical protein  34.33 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.865879 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  48.65 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  35.37 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  32.89 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  44.44 
 
 		 263 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  36.21 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  41 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  34.29 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  30.95 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  24.81 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  42.62 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  34.88 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  35.06 
 
 		 250 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  32.69 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  36.99 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  38.2 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  35.09 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  32.03 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  36.59 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  31.93 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  36.23 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3772  hypothetical protein  35.29 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  32.29 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  34.51 
 
 		 119 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  31.91 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  30.12 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  27.21 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  32.31 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  26.79 
 
 		 164 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  39.34 
 
 		 194 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>