More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2019 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2019  aldo/keto reductase  100 
 
 
380 aa  793    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  62.73 
 
 
381 aa  497  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  58.05 
 
 
400 aa  455  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  56.81 
 
 
399 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  56.08 
 
 
406 aa  436  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  55.29 
 
 
400 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  55.26 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  51.87 
 
 
384 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  52.74 
 
 
376 aa  408  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  53 
 
 
383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.99 
 
 
382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  52.52 
 
 
377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  51.96 
 
 
377 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  52.12 
 
 
400 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  51.72 
 
 
401 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  52.27 
 
 
376 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  51.84 
 
 
399 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  52.36 
 
 
397 aa  390  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  48.42 
 
 
408 aa  385  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  47.89 
 
 
409 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  49.07 
 
 
413 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  48.42 
 
 
409 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  49.07 
 
 
410 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  48.94 
 
 
379 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  48.4 
 
 
379 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
381 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  47.24 
 
 
379 aa  348  7e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  47.11 
 
 
396 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  44.03 
 
 
397 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  44.09 
 
 
371 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  40.59 
 
 
374 aa  290  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  37.44 
 
 
376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  34.11 
 
 
374 aa  202  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  33.42 
 
 
375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0701  aldo/keto reductase  31.99 
 
 
368 aa  190  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0135874  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  32.89 
 
 
370 aa  190  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  32.34 
 
 
364 aa  189  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0769  Fe-S oxidoreductase  31.82 
 
 
379 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000125779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1057  aldo/keto reductase  32.89 
 
 
374 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1621  aldo/keto reductase  32.53 
 
 
380 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2587  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
368 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  28.31 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  30.57 
 
 
337 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  27.75 
 
 
376 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0407  aldo/keto reductase  28.42 
 
 
383 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  27.65 
 
 
365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  27.46 
 
 
371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  26.68 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3250  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  25.85 
 
 
374 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  27.79 
 
 
376 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  25.85 
 
 
374 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  26.84 
 
 
340 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  27.39 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  27.23 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0272  aldo/keto reductase  23.38 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0446  aldo/keto reductase  30.18 
 
 
320 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.52 
 
 
350 aa  96.3  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0779  hypothetical protein  23.57 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000590838 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0602  oxidoreductase  26.36 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05031  aldo/keto reductase  25.46 
 
 
380 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04651  aldo/keto reductase  26.18 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.205889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  29.14 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  29.04 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  33.78 
 
 
345 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  27.48 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  32.75 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1760  oxidoreductase  25.58 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  26.77 
 
 
317 aa  89.7  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04961  aldo/keto reductase  25.07 
 
 
365 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.583752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  27.27 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1193  aldo/keto reductase  30.53 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0440  aldo/keto reductase  25.37 
 
 
380 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  29.07 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  28.95 
 
 
347 aa  86.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  27.08 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  27.37 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  27.21 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  30.53 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  29.93 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  26.67 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  27.38 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  26.09 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  32.33 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  29.96 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  27.38 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1747  hypothetical protein  24.32 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.482758  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  26.67 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  28.08 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  30.87 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  25.85 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2076  aldo/keto reductase  27 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  27.48 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  31.74 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  27.31 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  23.41 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  28.52 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  22.96 
 
 
312 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  27.31 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  30.08 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>