36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2077 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2077  BRAMP  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00766184  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0810  BRAMP  69.01 
 
 		 233 aa  322  2e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.22904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1423  hypothetical protein  47.76 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10403  hypothetical protein  44.55 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10943  hypothetical protein  43.5 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2691  hypothetical protein  46.23 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3009  hypothetical protein  42.79 
 
 		 249 aa  165  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2720  hypothetical protein  41.79 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00344324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2466  hypothetical protein  42.44 
 
 		 243 aa  158  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00315756  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4864  hypothetical protein  45.99 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7142  hypothetical protein  41.95 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  41.75 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2564  hypothetical protein  40.2 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2527  hypothetical protein  40.2 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2572  hypothetical protein  40.2 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0417  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4331  manganese transport protein  38.18 
 
 		 201 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4745  hypothetical protein  35.68 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4291  hypothetical protein  35.96 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1969  hypothetical protein  40.51 
 
 		 207 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256176  normal  0.256404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3624  hypothetical protein  47.59 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1830  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  36.31 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00348996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  23.08 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  28.42 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1130  NADPH-dependent FMN reductase  28.42 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  25.71 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  30.16 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1677  EIF-4a family ATP-dependent RNA helicase  25.81 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.42151  hitchhiker  0.000000240044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  25.62 
 
 		 217 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 		 193 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  30.4 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>