32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4864 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4864  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  408  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588631  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4331  manganese transport protein  50.61 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1969  hypothetical protein  47.88 
 
 
207 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256176  normal  0.256404 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  50.97 
 
 
205 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4745  hypothetical protein  46.67 
 
 
206 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7142  hypothetical protein  47.1 
 
 
205 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2564  hypothetical protein  46.56 
 
 
209 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2527  hypothetical protein  49.7 
 
 
209 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2572  hypothetical protein  49.7 
 
 
209 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2077  BRAMP  45.88 
 
 
216 aa  153  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00766184  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0810  BRAMP  43.52 
 
 
233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.22904  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0417  NADPH-dependent FMN reductase  39.8 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4291  hypothetical protein  37.44 
 
 
210 aa  144  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10403  hypothetical protein  36.82 
 
 
236 aa  137  8.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1423  hypothetical protein  39.39 
 
 
248 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2691  hypothetical protein  38.69 
 
 
234 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3624  hypothetical protein  48.37 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10943  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3009  hypothetical protein  37.86 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2720  hypothetical protein  37.38 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00344324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2466  hypothetical protein  39.64 
 
 
243 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00315756  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1830  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  32.88 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00348996  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  22.15 
 
 
236 aa  52.4  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  22.5 
 
 
374 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  29.11 
 
 
262 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  25.13 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  25.39 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  23.03 
 
 
183 aa  45.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  25.89 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  27.22 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  27.69 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  27.72 
 
 
205 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>