39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0417 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0417  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  68.34 
 
 		 205 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7142  hypothetical protein  66.33 
 
 		 205 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4291  hypothetical protein  61.31 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4745  hypothetical protein  49.75 
 
 		 206 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2527  hypothetical protein  52.74 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2572  hypothetical protein  52.74 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2564  hypothetical protein  52.74 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1969  hypothetical protein  50 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256176  normal  0.256404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4331  manganese transport protein  48.21 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3624  hypothetical protein  53.49 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4864  hypothetical protein  40.54 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0810  BRAMP  38 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.22904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2077  BRAMP  38 
 
 		 216 aa  134  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00766184  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1423  hypothetical protein  37.38 
 
 		 248 aa  131  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2691  hypothetical protein  33.66 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10403  hypothetical protein  34.13 
 
 		 236 aa  118  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2466  hypothetical protein  35.84 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00315756  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2720  hypothetical protein  34.13 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00344324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3009  hypothetical protein  34.15 
 
 		 249 aa  111  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10943  hypothetical protein  31.53 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1830  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  32.47 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00348996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  22.33 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.24 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  30.17 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  28.45 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  27.88 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  24.83 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  31.96 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  26.24 
 
 		 195 aa  45.1  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0597  hypothetical protein  29.31 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0583  hypothetical protein  29.31 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.600123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  22.73 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  28.7 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  24.56 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  27.33 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  27.52 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  23.08 
 
 		 191 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  27.59 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>