36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10403 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10403  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  491  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1423  hypothetical protein  60.34 
 
 
248 aa  321  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2466  hypothetical protein  60.67 
 
 
243 aa  321  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00315756  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2720  hypothetical protein  61.9 
 
 
240 aa  317  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00344324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3009  hypothetical protein  60 
 
 
249 aa  315  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10943  hypothetical protein  59.15 
 
 
245 aa  312  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2691  hypothetical protein  59.21 
 
 
234 aa  304  7e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0810  BRAMP  45.24 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.22904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2077  BRAMP  44.55 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00766184  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4864  hypothetical protein  37.7 
 
 
201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588631  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7142  hypothetical protein  34.6 
 
 
205 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4745  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  34.3 
 
 
205 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0417  NADPH-dependent FMN reductase  34.13 
 
 
205 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4331  manganese transport protein  36.9 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1969  hypothetical protein  37.89 
 
 
207 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256176  normal  0.256404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2564  hypothetical protein  36.02 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2527  hypothetical protein  36.02 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2572  hypothetical protein  36.02 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4291  hypothetical protein  31.58 
 
 
210 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3624  hypothetical protein  36.81 
 
 
205 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1830  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  33.58 
 
 
192 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00348996  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  25.89 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  27.37 
 
 
187 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1125  NADPH-dependent FMN reductase  25.42 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000715162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.21 
 
 
374 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  23.78 
 
 
197 aa  46.2  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  27.04 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  25.51 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  28.04 
 
 
182 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  30.25 
 
 
211 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0629  multimeric flavodoxin WrbA-like  21.92 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.155338  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2568  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.08 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 
184 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  34 
 
 
188 aa  42  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
193 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>