26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7142 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_7142  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  90.15 
 
 
205 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0417  NADPH-dependent FMN reductase  66.33 
 
 
205 aa  278  5e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4291  hypothetical protein  64.68 
 
 
210 aa  275  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4745  hypothetical protein  51.24 
 
 
206 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1969  hypothetical protein  52.76 
 
 
207 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256176  normal  0.256404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2527  hypothetical protein  51.49 
 
 
209 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2572  hypothetical protein  51.49 
 
 
209 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2564  hypothetical protein  51.49 
 
 
209 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3624  hypothetical protein  56.72 
 
 
205 aa  179  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4331  manganese transport protein  49.24 
 
 
201 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4864  hypothetical protein  47.1 
 
 
201 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588631  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0810  BRAMP  41.29 
 
 
233 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.22904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2077  BRAMP  41.95 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00766184  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2691  hypothetical protein  38.42 
 
 
234 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1423  hypothetical protein  39.69 
 
 
248 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10403  hypothetical protein  34.6 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10943  hypothetical protein  36.79 
 
 
245 aa  121  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2466  hypothetical protein  35.9 
 
 
243 aa  118  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00315756  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3009  hypothetical protein  37.43 
 
 
249 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2720  hypothetical protein  36.84 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00344324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1830  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  29.8 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00348996  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  26.97 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.52 
 
 
374 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  26.32 
 
 
221 aa  45.1  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  29.03 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>