18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0955 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0955  signaling modulator of AmpD, AmpE  100 
 
 		 295 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0781  signaling modulator of AmpD, AmpE  29.02 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0951  ampE protein  28.82 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0790  signaling modulator of AmpD, AmpE  28.44 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0813  signaling modulator of AmpD, AmpE  27.91 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0788  AmpE  29.25 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689986  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4404  signaling modulator of AmpD, AmpE  30.71 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0824  signaling modulator of AmpD, AmpE  25.59 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0818  ampE protein  28.32 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927721  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12130  Inner membrane protein  27.98 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.567702  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0877  signaling modulator of AmpD, AmpE  23.59 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0027178  normal  0.0245194 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0638  signaling modulator of AmpD, AmpE  24.84 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58660  hypothetical protein  29.09 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.9 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5138  hypothetical protein  32.62 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  28.57 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  27.36 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  30.56 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>