220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0753 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0753  phosphoglyceromutase  100 
 
 
546 aa  1122    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0233  phosphoglyceromutase  64.59 
 
 
546 aa  732    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2410  phosphoglyceromutase  61.31 
 
 
550 aa  655    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716907  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6862  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  58.68 
 
 
552 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.109748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0072  phosphoglyceromutase  64.3 
 
 
550 aa  722    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33106  predicted protein  49.73 
 
 
547 aa  504  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0393465  normal  0.249426 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  39.73 
 
 
512 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  41.79 
 
 
505 aa  348  1e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  38.84 
 
 
512 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  40 
 
 
512 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  39.81 
 
 
512 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  41.21 
 
 
508 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  40.76 
 
 
511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  39.73 
 
 
514 aa  339  7e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  38.27 
 
 
525 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  39.58 
 
 
513 aa  336  5e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  38.83 
 
 
518 aa  336  5e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  41.33 
 
 
511 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  40 
 
 
512 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  39.62 
 
 
513 aa  334  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  37.67 
 
 
512 aa  333  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  40.65 
 
 
511 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  40.99 
 
 
511 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  39.31 
 
 
509 aa  330  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  38.68 
 
 
510 aa  329  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  37.33 
 
 
517 aa  329  8e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  39.28 
 
 
509 aa  329  8e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  39.51 
 
 
529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  39.81 
 
 
518 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  39.81 
 
 
516 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  41.71 
 
 
510 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  39.2 
 
 
510 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  39.28 
 
 
516 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  37.96 
 
 
516 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  39.28 
 
 
516 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  39.43 
 
 
509 aa  325  9e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  41.97 
 
 
511 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  39.43 
 
 
509 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  39.43 
 
 
509 aa  325  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  39.43 
 
 
509 aa  325  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  36.74 
 
 
512 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  39.1 
 
 
511 aa  324  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  37.48 
 
 
512 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  39.06 
 
 
509 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  37.48 
 
 
512 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  39.25 
 
 
509 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  39.25 
 
 
509 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  35.81 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  38.43 
 
 
510 aa  320  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  38.87 
 
 
509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  37.66 
 
 
512 aa  319  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  38.35 
 
 
516 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  39.62 
 
 
511 aa  318  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  36.57 
 
 
511 aa  318  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  38.99 
 
 
521 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  37.83 
 
 
511 aa  317  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  38.67 
 
 
515 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  38.49 
 
 
511 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  38.94 
 
 
513 aa  316  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  38.52 
 
 
509 aa  316  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  38.36 
 
 
515 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  38.86 
 
 
514 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  38.86 
 
 
514 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  38.55 
 
 
514 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  38.55 
 
 
514 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  38.86 
 
 
514 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  38.86 
 
 
514 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  38.86 
 
 
514 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  38.86 
 
 
514 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  38.86 
 
 
514 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 
510 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  37.79 
 
 
519 aa  312  7.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  38.29 
 
 
514 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  38.29 
 
 
514 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  37.4 
 
 
514 aa  312  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  38.11 
 
 
509 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  37.29 
 
 
519 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  37.98 
 
 
514 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  37.98 
 
 
514 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  37.29 
 
 
519 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  38.02 
 
 
514 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  38.02 
 
 
514 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  38.29 
 
 
514 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  37.2 
 
 
524 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  38.83 
 
 
511 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  38.02 
 
 
514 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  38.71 
 
 
514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  37.28 
 
 
510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  37.62 
 
 
520 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  37.83 
 
 
514 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  37.48 
 
 
552 aa  307  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  37.17 
 
 
530 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  37.25 
 
 
514 aa  307  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  37.79 
 
 
514 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  36.83 
 
 
514 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  37.79 
 
 
514 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  36.5 
 
 
513 aa  306  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  37.6 
 
 
514 aa  306  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  37.79 
 
 
514 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  36.12 
 
 
514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>