More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0450 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0450  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
397 aa  812    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.67394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4899  S-adenosylmethionine synthetase  56.57 
 
 
394 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.050537  normal  0.0132023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1303  S-adenosylmethionine synthetase  55.38 
 
 
394 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0036  S-adenosylmethionine synthetase  56.09 
 
 
396 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3004  S-adenosylmethionine synthetase  52.99 
 
 
410 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3115  S-adenosylmethionine synthetase  52.99 
 
 
410 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0919  S-adenosylmethionine synthetase  50.38 
 
 
396 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1562  S-adenosylmethionine synthetase  49.87 
 
 
392 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  46.45 
 
 
418 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  46.08 
 
 
420 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  46.77 
 
 
403 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  45.1 
 
 
420 aa  362  7.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  46.88 
 
 
403 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  45.72 
 
 
417 aa  361  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  45.23 
 
 
421 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  47.46 
 
 
396 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  46.85 
 
 
397 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  45.59 
 
 
395 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  47.24 
 
 
395 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  44.25 
 
 
422 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  44.25 
 
 
422 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  45.34 
 
 
396 aa  344  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  46.06 
 
 
399 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  46.06 
 
 
399 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  46.06 
 
 
399 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  46.06 
 
 
399 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  46.06 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  46.06 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  46.06 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  46.06 
 
 
399 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  45.86 
 
 
399 aa  342  8e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  45.81 
 
 
399 aa  342  8e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  45.59 
 
 
396 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  47.39 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  45.57 
 
 
399 aa  339  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4838  S-adenosylmethionine synthetase  45.72 
 
 
424 aa  339  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000220213  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03451  S-adenosylmethionine synthetase  45.59 
 
 
410 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.536517  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  44.86 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  42.68 
 
 
396 aa  335  7e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  45.84 
 
 
395 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  43.67 
 
 
405 aa  332  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  43.07 
 
 
396 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  45.34 
 
 
396 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  44.84 
 
 
396 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03441  S-adenosylmethionine synthetase  43.58 
 
 
413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03361  S-adenosylmethionine synthetase  43.47 
 
 
413 aa  325  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  43.67 
 
 
402 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  44.5 
 
 
405 aa  323  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22181  S-adenosylmethionine synthetase  45.93 
 
 
419 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03351  S-adenosylmethionine synthetase  43.22 
 
 
413 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04001  S-adenosylmethionine synthetase  45.69 
 
 
409 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.222949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  44.58 
 
 
397 aa  322  7e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0317  S-adenosylmethionine synthetase  43.47 
 
 
413 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  44.05 
 
 
395 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1687  S-adenosylmethionine synthetase  45.43 
 
 
409 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  43.69 
 
 
406 aa  319  5e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  44 
 
 
405 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  43.43 
 
 
406 aa  316  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0466  S-adenosylmethionine synthetase  45.2 
 
 
411 aa  315  6e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  43.18 
 
 
406 aa  315  8e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1869  S-adenosylmethionine synthetase  44.95 
 
 
408 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  45.39 
 
 
399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  43.46 
 
 
414 aa  312  9e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  44.58 
 
 
399 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  43.86 
 
 
396 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  43.26 
 
 
396 aa  311  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  42.82 
 
 
395 aa  310  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  42.82 
 
 
395 aa  310  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  43.89 
 
 
402 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  44.97 
 
 
403 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  45.39 
 
 
399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  45.29 
 
 
391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  45.29 
 
 
391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  41.92 
 
 
393 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  41.56 
 
 
399 aa  309  5e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  44.47 
 
 
403 aa  306  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
398 aa  305  8.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  41.81 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  42.79 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  41.81 
 
 
398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  42.11 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  43.03 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  43.8 
 
 
397 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  40.39 
 
 
402 aa  300  4e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  42.21 
 
 
397 aa  299  5e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 
401 aa  299  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  42.96 
 
 
417 aa  299  7e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4357  S-adenosylmethionine synthetase  44.72 
 
 
410 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808224  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  43.03 
 
 
398 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  43.22 
 
 
399 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 
387 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  42.64 
 
 
403 aa  295  9e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  40.8 
 
 
393 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  42.29 
 
 
398 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2439  S-adenosylmethionine synthetase  42.6 
 
 
396 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  42.89 
 
 
400 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  43.07 
 
 
387 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  43.72 
 
 
395 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  40.55 
 
 
393 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  42.71 
 
 
397 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>