70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01924 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01924  transposase  100 
 
 
48 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.195787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02877  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01517  transposase  79.17 
 
 
306 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01663  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01672  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02152  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02447  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03012  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04803  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06899  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06380  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06678  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06818  hypothetical protein  79.17 
 
 
306 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05901  hypothetical protein  79.17 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00550  hypothetical protein  79.17 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04740  hypothetical protein  77.08 
 
 
306 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05981  hypothetical protein  77.08 
 
 
220 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07125  hypothetical protein  77.08 
 
 
306 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1722  transposase IS4 family protein  77.08 
 
 
306 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287576  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3475  transposase IS4 family protein  77.08 
 
 
306 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0603  transposase IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4398  transposase IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4648  transposase IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3528  transposase, IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4333  transposase IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3033  transposase, IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2717  transposase, IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0465526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2611  transposase, IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1837  transposase, IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1094  transposase, IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0900  transposase, IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4184  transposase IS4 family protein  72.92 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3139  transposase, IS4 family protein  72.92 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4445  transposase, IS4 family protein  72.92 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0631  transposase IS4 family protein  70.83 
 
 
307 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301293  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1723  IS4 family transposase  70.83 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.060513 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05997  hypothetical protein  70.83 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1860  IS4 family transposase  70.83 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.876835  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05985  hypothetical protein  70.83 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1780  IS4 family transposase  70.83 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2114  IS4 family transposase  70.83 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3656  IS4 family transposase  70.83 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0806  IS4 family transposase  70.83 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0848  IS4 family transposase  70.83 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3098  IS4 family transposase  70.83 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0120  ISSod12, transposase  70.83 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3296  ISSod12, transposase  70.83 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06002  hypothetical protein  72.92 
 
 
306 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05975  hypothetical protein  70.45 
 
 
300 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05450  hypothetical protein  73.81 
 
 
46 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05989  hypothetical protein  70.45 
 
 
302 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3854  ISSod12, transposase  64.58 
 
 
307 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0342  putative transposase  70.73 
 
 
46 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01493  hypothetical protein  74.36 
 
 
40 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2261  IS903 transposase  57.45 
 
 
307 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0214  transposase, IS4 family protein  57.45 
 
 
307 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2918  transposase, IS4 family protein  56.25 
 
 
305 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3109  putative transposase  51.06 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000406052 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4282  IS4 family transposase  52.08 
 
 
245 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4306  IS4 family transposase  52.08 
 
 
226 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.482317  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3055  putative transposase  47.83 
 
 
74 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03002  hypothetical protein  76.67 
 
 
289 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2179  transposase, IS4 family protein  47.92 
 
 
305 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.602242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0625  transposase, IS4 family protein  47.92 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2534  transposase, IS4 family protein  43.75 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0503362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3487  transposase IS4 family protein  45.83 
 
 
320 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04731  hypothetical protein  55.26 
 
 
38 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05905  hypothetical protein  55.26 
 
 
38 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2245  transposase, IS4 family protein  44.44 
 
 
49 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  hitchhiker  0.00350399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>