More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2050 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2050  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  249  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000730652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0765  response regulator receiver protein  75.78 
 
 		 130 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4608  response regulator receiver domain-containing protein  61.98 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2326  response regulator receiver domain-containing protein  53.78 
 
 		 132 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1010  chemotaxis protein CheY  47.9 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1850  response regulator receiver protein  60.19 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03243  chemotaxis protein CheY  39.67 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  50.89 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  45.87 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  48.65 
 
 		 132 aa  92  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 129 aa  91.3  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 128 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  46.85 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.62 
 
 		 1303 aa  90.5  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  47.75 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 120 aa  90.5  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  45.28 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  44.64 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 127 aa  90.5  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  45.76 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 		 123 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  45.28 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  45.95 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  45.95 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  41.07 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  41.67 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2729  response regulator receiver domain-containing protein  45.79 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  45.95 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  45.95 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  46.85 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  39.64 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  43.75 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  43.75 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  43.75 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  43.75 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  43.75 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  43.75 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  43.75 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  45.54 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  42.86 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  44.64 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  45.45 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  44.64 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  46.3 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  45.05 
 
 		 188 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  43.75 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  42.31 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  43.75 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  44.64 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 740 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  36.97 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  45.05 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  45.05 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  45.05 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  46.43 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  45.05 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  46.43 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  45.05 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  45.05 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  45.05 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  43.27 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  42.31 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>