More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1034 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
204 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  87.68 
 
 
207 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  72.11 
 
 
217 aa  259  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  71.96 
 
 
217 aa  256  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  77.84 
 
 
212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  70 
 
 
206 aa  235  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  65.28 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  55.61 
 
 
194 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  55.38 
 
 
195 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  56.7 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  56.99 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  55.5 
 
 
222 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 
201 aa  194  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  57.44 
 
 
207 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  53.06 
 
 
194 aa  191  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  53.68 
 
 
199 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  55.26 
 
 
201 aa  188  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  54.69 
 
 
199 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  58.25 
 
 
197 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  58.38 
 
 
211 aa  184  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  52.36 
 
 
199 aa  184  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  57.73 
 
 
197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  51.3 
 
 
203 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  54.36 
 
 
194 aa  181  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  52.24 
 
 
199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  52.08 
 
 
199 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  51.58 
 
 
200 aa  179  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  56.7 
 
 
197 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  61.85 
 
 
198 aa  178  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  51.05 
 
 
200 aa  177  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  52.06 
 
 
201 aa  174  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  51.56 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  56.35 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  51.81 
 
 
202 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  54.86 
 
 
204 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  55.43 
 
 
198 aa  168  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  54.17 
 
 
199 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  52.06 
 
 
203 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  52.6 
 
 
197 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  55.87 
 
 
229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  58.86 
 
 
215 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  43.81 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  42.37 
 
 
201 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  46.63 
 
 
210 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  45.32 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  45.81 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  46.57 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  43.16 
 
 
202 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  42.78 
 
 
204 aa  117  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  42.63 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  43.16 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  37.25 
 
 
220 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  38.02 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  39.68 
 
 
207 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  39.15 
 
 
207 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  39.15 
 
 
207 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  35.45 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  42.11 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  42.11 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  42.11 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  38.62 
 
 
207 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2828  dephospho-CoA kinase  38.81 
 
 
204 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  42.78 
 
 
192 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  43.07 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  34.52 
 
 
199 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  42.64 
 
 
214 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  34.55 
 
 
200 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  38.38 
 
 
202 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  40.84 
 
 
202 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2316  dephospho-CoA kinase  32.26 
 
 
203 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  31.61 
 
 
198 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  36.87 
 
 
202 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2167  dephospho-CoA kinase  36.17 
 
 
199 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.993238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  35.26 
 
 
202 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  34.55 
 
 
200 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  39.8 
 
 
208 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  34.55 
 
 
200 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  34.55 
 
 
200 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 
200 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  37.36 
 
 
200 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 
202 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  38.14 
 
 
203 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  35.15 
 
 
199 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  36.52 
 
 
200 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  34.55 
 
 
200 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  37.63 
 
 
203 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  28.87 
 
 
297 aa  105  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  38.62 
 
 
207 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  34.02 
 
 
201 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  29.59 
 
 
198 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  41.27 
 
 
202 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  43.02 
 
 
201 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  36.36 
 
 
201 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0277  dephospho-CoA kinase  31.44 
 
 
200 aa  102  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  38 
 
 
218 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  38.12 
 
 
541 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  43.75 
 
 
219 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  30.48 
 
 
209 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  35.8 
 
 
200 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  40.21 
 
 
430 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>