36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0914 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  100 
 
 		 323 aa  665    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  49.06 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  47.42 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  48.32 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  48.32 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  48.43 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  44.51 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  50 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  39.27 
 
 		 503 aa  202  8e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  38.94 
 
 		 503 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  41.67 
 
 		 318 aa  192  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  38.1 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  42.95 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  34.86 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  39.07 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  35.33 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  37.94 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  37.38 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  36 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  33.23 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  33.74 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  32.98 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  35.67 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  34.37 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  32.63 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  31.8 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  34.1 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  30.31 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  30.86 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  28.49 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  31.79 
 
 		 315 aa  95.9  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  27.45 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  31.91 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  28.72 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0936  GHMP kinase domain-containing protein  26.71 
 
 		 402 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579277  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4285  GHMP kinase C terminal domain-containing protein  26.3 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0398897  normal  0.0848141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>