29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2023 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  99.05 
 
 
315 aa  647    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  33.04 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  31.27 
 
 
360 aa  132  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  32.15 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  31.56 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  32.23 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  34.33 
 
 
321 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  29.29 
 
 
325 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  29.75 
 
 
404 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  29.58 
 
 
503 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  32.56 
 
 
314 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  29.58 
 
 
503 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  29.01 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  30.55 
 
 
327 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  29.57 
 
 
295 aa  94  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  33.22 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  32.11 
 
 
327 aa  93.2  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  32.11 
 
 
327 aa  93.2  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  32.47 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  29.62 
 
 
395 aa  91.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  28.98 
 
 
387 aa  89.4  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  28.15 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  28.47 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  32.57 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  29.97 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  24.53 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  25 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  28.66 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>