35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0706 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  100 
 
 
312 aa  630  1e-180  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  34.28 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  31.99 
 
 
332 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  30.6 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  32.28 
 
 
327 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  32.28 
 
 
327 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  31.23 
 
 
323 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  30.52 
 
 
503 aa  123  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  30.19 
 
 
503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  29.21 
 
 
325 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  31.58 
 
 
318 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  28.34 
 
 
327 aa  119  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  30.26 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  29.63 
 
 
395 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  31.08 
 
 
295 aa  105  8e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  28.01 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  28.99 
 
 
314 aa  95.9  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  23.69 
 
 
323 aa  86.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  29.31 
 
 
365 aa  86.7  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  27.53 
 
 
404 aa  85.9  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  30.77 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  28.08 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  26.2 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  24.92 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  27.54 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  25.66 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  27.01 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  28.87 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  28.52 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  24.7 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  25.86 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  25 
 
 
327 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  21.35 
 
 
389 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4285  GHMP kinase C terminal domain-containing protein  21.52 
 
 
376 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0398897  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  21.41 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>