41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0239 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  100 
 
 		 327 aa  681    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  72.48 
 
 		 327 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  72.48 
 
 		 327 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  47.42 
 
 		 323 aa  263  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  46.88 
 
 		 321 aa  262  6.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  42.42 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  42.09 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  39.23 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  42.45 
 
 		 318 aa  202  9e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  44.44 
 
 		 365 aa  192  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  40.33 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  38.39 
 
 		 503 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  38.34 
 
 		 503 aa  186  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  39.41 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  37.46 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  37.22 
 
 		 295 aa  179  7e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  36.09 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  37.77 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  38.03 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  29.62 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  30.63 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  42.16 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  34.05 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  31.31 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  29.65 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  29.58 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  28.67 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  28.12 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  29.19 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  30.13 
 
 		 389 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  31.21 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  30.87 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  28.57 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  30.35 
 
 		 360 aa  85.9  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4285  GHMP kinase C terminal domain-containing protein  24.76 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0398897  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0936  GHMP kinase domain-containing protein  25.41 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579277  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0094  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  27.41 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1538  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  28.43 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00561271  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1826  GHMP kinase  21.03 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1451  GHMP kinase  21.15 
 
 		 359 aa  42.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0518145  normal  0.0558976 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  33.08 
 
 		 317 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>