32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1389 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  100 
 
 		 368 aa  768    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  59.18 
 
 		 360 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  60.71 
 
 		 342 aa  421  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  33.04 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  32.74 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  28.61 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  28.94 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  28.17 
 
 		 503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  28.17 
 
 		 503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  29.19 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  30.28 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  29.94 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  27.78 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  27.78 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  25.66 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  29.58 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  28.4 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  27.61 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  26.89 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  25.72 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  24.63 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  25.29 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  27.59 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  22.55 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  25.88 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  24.7 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  27.44 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  25 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  26.98 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  24.86 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  23.78 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  23.29 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>