38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1101 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  100 
 
 
314 aa  642    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  50.85 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  49.67 
 
 
318 aa  256  5e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  44.59 
 
 
321 aa  224  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  44.03 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  42.42 
 
 
327 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  42 
 
 
327 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  42 
 
 
327 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  36.59 
 
 
332 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  36.51 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  34.35 
 
 
503 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  40.54 
 
 
365 aa  155  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.01 
 
 
503 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  37.13 
 
 
314 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  33.97 
 
 
314 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  35.62 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  35.31 
 
 
325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  32.82 
 
 
395 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  35.67 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  30.26 
 
 
312 aa  133  5e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  38.79 
 
 
337 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  33.33 
 
 
387 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  28.84 
 
 
323 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  29.43 
 
 
404 aa  105  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  32.67 
 
 
315 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  33 
 
 
315 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  28.48 
 
 
323 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  30.9 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  28.03 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  28.75 
 
 
389 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  26.8 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0936  GHMP kinase domain-containing protein  25.24 
 
 
402 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579277  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  27.62 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4285  GHMP kinase C terminal domain-containing protein  26.02 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0398897  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  24.63 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  27.49 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0056  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  47.54 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2861  GHMP family kinase  23.36 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>