34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0455 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  100 
 
 		 318 aa  660    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  51.28 
 
 		 313 aa  296  4e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  49.5 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  43.59 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  44.55 
 
 		 327 aa  205  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  44.55 
 
 		 327 aa  205  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  42.45 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  41.67 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  45.36 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  37.85 
 
 		 332 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  34.09 
 
 		 503 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.77 
 
 		 503 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  31.58 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  33.33 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  33.23 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  35.74 
 
 		 314 aa  135  9e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  35.79 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  34.36 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  35.58 
 
 		 387 aa  125  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  33.68 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  34.74 
 
 		 404 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  37.14 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  34.11 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  32.42 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  32.42 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  26.74 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  29.52 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  26.32 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  27.03 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  27.5 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  27.24 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  25.52 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  27.41 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  25 
 
 		 389 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>