36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1734 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  100 
 
 		 332 aa  691    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  47.73 
 
 		 503 aa  308  5.9999999999999995e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  47.13 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  41.39 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  41.39 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  39.23 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  41.29 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  39.37 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  36.97 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  35.47 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  37.67 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  41 
 
 		 365 aa  155  7e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  37.59 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  37.85 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  33.01 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  36.59 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  35.83 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  35.79 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  33.45 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  31.99 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  41.61 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  35.71 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  32.51 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  31.76 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  27.33 
 
 		 368 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  29.94 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  28.34 
 
 		 332 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  27.53 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  31.56 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  31.13 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  26.46 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  25.09 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  26.96 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  27.12 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0936  GHMP kinase domain-containing protein  25.9 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579277  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4285  GHMP kinase C terminal domain-containing protein  26.83 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0398897  normal  0.0848141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>