24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4285 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4285  GHMP kinase C terminal domain-containing protein  100 
 
 		 376 aa  756    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0398897  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0936  GHMP kinase domain-containing protein  88.5 
 
 		 402 aa  620  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579277  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  63.98 
 
 		 389 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  34.83 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  31.55 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  30.65 
 
 		 327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  33.33 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  30.95 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  24.12 
 
 		 321 aa  93.2  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  24.35 
 
 		 327 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  27.24 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  27.24 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  29.01 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  27.71 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  28.72 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  27.78 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  20.89 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  26.4 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  30.07 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  24.14 
 
 		 503 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  22.71 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  26.64 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  24.14 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  34.12 
 
 		 325 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>