More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0145 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0145  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 419 aa  860    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000216858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.52 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.76 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.04 
 
 		 423 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.28 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.76 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.04 
 
 		 423 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.8 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.04 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1601  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.86 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.12 
 
 		 423 aa  359  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0058  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.87 
 
 		 420 aa  358  7e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0043  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.63 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0880  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.65 
 
 		 422 aa  348  8e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1034  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.13 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.74 
 
 		 430 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0659  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.58 
 
 		 413 aa  329  5.0000000000000004e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.80081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.81 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0700  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.83 
 
 		 414 aa  326  5e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.06 
 
 		 429 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.56 
 
 		 430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1134  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.15 
 
 		 415 aa  318  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1156  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.15 
 
 		 415 aa  318  7.999999999999999e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 430 aa  317  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 		 437 aa  316  6e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.63 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.92 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.43 
 
 		 425 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.23 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.29 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 		 430 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 		 426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.18 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  41 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.29 
 
 		 428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.29 
 
 		 428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.81 
 
 		 422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.55 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.38 
 
 		 419 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.55 
 
 		 425 aa  306  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1683  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.84 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.53 
 
 		 422 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.76 
 
 		 426 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 		 432 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.28 
 
 		 428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.46 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.98 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.55 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2871  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.09 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0927595 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.98 
 
 		 422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.92 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.51 
 
 		 422 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.69 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  42.42 
 
 		 430 aa  302  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.08 
 
 		 425 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.95 
 
 		 425 aa  302  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.09 
 
 		 427 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 		 429 aa  302  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0036  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.37 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.413084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1239  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.12 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.98 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 		 429 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.02 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.02 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.01 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.09 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.62 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 		 422 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.59 
 
 		 422 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 429 aa  299  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.94 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.65 
 
 		 430 aa  299  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.88 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.9 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.91 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.37 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.88 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.63 
 
 		 430 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.38 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2459  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  41.88 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.19 
 
 		 430 aa  298  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>