More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3292 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 248 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  70.97 
 
 		 250 aa  333  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  65.18 
 
 		 249 aa  324  8.000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  66.94 
 
 		 247 aa  322  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  65.99 
 
 		 251 aa  314  7e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  65.71 
 
 		 252 aa  314  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  64.78 
 
 		 250 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  68.38 
 
 		 241 aa  308  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  64.63 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  65.73 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  63.18 
 
 		 259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  61.48 
 
 		 248 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  66.13 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  64.63 
 
 		 259 aa  296  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  61.02 
 
 		 238 aa  294  1e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  58.75 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  58.16 
 
 		 246 aa  289  4e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  59.66 
 
 		 238 aa  288  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  58.9 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  58.2 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  62.55 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  59.35 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  64.54 
 
 		 252 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  62.66 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  60 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  62.66 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  60.56 
 
 		 254 aa  285  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  62.66 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  62.66 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  62.66 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  64.54 
 
 		 252 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  59.29 
 
 		 255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  62.23 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  62.23 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  62.23 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  62.23 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  62.23 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  62.23 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  62.23 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  62.23 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  62.23 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  59.45 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  60.66 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  64.73 
 
 		 245 aa  281  6.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  59.83 
 
 		 241 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  59.06 
 
 		 256 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  59.06 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  61.89 
 
 		 245 aa  278  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  58.66 
 
 		 265 aa  277  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  58.58 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  65.18 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  65.84 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  59.92 
 
 		 248 aa  275  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  61.09 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  59.24 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  59.02 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  57.72 
 
 		 250 aa  268  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  57.38 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  57.03 
 
 		 264 aa  268  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  52.87 
 
 		 250 aa  268  8e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  60.96 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  56.97 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  56.72 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  58.2 
 
 		 244 aa  264  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  63.01 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  56.56 
 
 		 253 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1356  integral membrane protein TerC  58.58 
 
 		 255 aa  261  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.764248  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  61.89 
 
 		 249 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  61.22 
 
 		 254 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  51.43 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  53.88 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  51.48 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  51.48 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  52.99 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1788  hypothetical protein  61.38 
 
 		 254 aa  255  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.377991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  51.48 
 
 		 250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  55.41 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  55.42 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  56.39 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  52.34 
 
 		 518 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  53.94 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  51.29 
 
 		 254 aa  248  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  49.59 
 
 		 523 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  52.26 
 
 		 295 aa  247  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  50.85 
 
 		 518 aa  247  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  51.91 
 
 		 522 aa  247  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  50.85 
 
 		 523 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  50.85 
 
 		 523 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1471  integral membrane protein, TerC family  53.36 
 
 		 240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.848938  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  56.17 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  48.37 
 
 		 523 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  49.8 
 
 		 522 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  50.2 
 
 		 252 aa  244  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  55.41 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  50.44 
 
 		 510 aa  242  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  49.4 
 
 		 522 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  54.08 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  54.08 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  53.19 
 
 		 522 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4056  hypothetical protein  52.14 
 
 		 515 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>