More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3179 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3179  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
365 aa  731    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000698212 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  31.08 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2693  chaperone protein DnaJ  32.08 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357836  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  30.14 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  28.65 
 
 
378 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  28.65 
 
 
378 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  31.52 
 
 
380 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  29.81 
 
 
379 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  30 
 
 
370 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  29.81 
 
 
379 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  29.81 
 
 
379 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  29.81 
 
 
379 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  29.81 
 
 
379 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  29.78 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2467  DnaJ central region:heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  32.04 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0517285  normal  0.501224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  28.65 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  29.78 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  29.78 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  29.78 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  29.78 
 
 
376 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  31.74 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  29.27 
 
 
376 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  31.46 
 
 
377 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  31.46 
 
 
377 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  31.46 
 
 
377 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  29.51 
 
 
376 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  29.51 
 
 
376 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  29.27 
 
 
376 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  27.79 
 
 
377 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  28.3 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  28.3 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  31.37 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  27.84 
 
 
378 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  28.3 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  28.69 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  30.7 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3039  chaperone protein DnaJ  28.45 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000179446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  29.47 
 
 
382 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  31.18 
 
 
377 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  31.18 
 
 
377 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  29.3 
 
 
376 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  31.18 
 
 
377 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  27.93 
 
 
386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  30.75 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  28.95 
 
 
382 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  28.53 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  30.25 
 
 
376 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  31.04 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  28.11 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  28.84 
 
 
374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  29.22 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4164  chaperone protein DnaJ  28.78 
 
 
368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000033123  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  28.99 
 
 
374 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  27.3 
 
 
378 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  28.61 
 
 
375 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  28.8 
 
 
374 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  29.58 
 
 
376 aa  126  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0871  heat shock protein DnaJ  26.63 
 
 
387 aa  126  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.255126  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4394  chaperone protein DnaJ  28.82 
 
 
371 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000485596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  31.93 
 
 
375 aa  126  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4446  chaperone protein DnaJ  28.82 
 
 
371 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4335  chaperone protein DnaJ  28.53 
 
 
371 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7152000000000002e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4212  chaperone protein DnaJ  28.53 
 
 
371 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000364555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4050  chaperone protein DnaJ  28.53 
 
 
371 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  5.16235e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4538  chaperone protein DnaJ  28.53 
 
 
371 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000345209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4060  chaperone protein DnaJ  28.53 
 
 
371 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4432  chaperone protein DnaJ  28.82 
 
 
371 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000040586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0804  chaperone protein DnaJ  28.82 
 
 
371 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000435348  decreased coverage  1.53546e-22 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  28.46 
 
 
395 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  29.41 
 
 
370 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  27.27 
 
 
381 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  29.58 
 
 
376 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  26.98 
 
 
380 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  27.27 
 
 
377 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  27.25 
 
 
394 aa  123  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  27.04 
 
 
376 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  29.71 
 
 
375 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  30.77 
 
 
382 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  29.17 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  26.11 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  28.12 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  26.13 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1183  chaperone protein DnaJ  30.09 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000246856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  28.16 
 
 
376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0560  chaperone protein DnaJ  28.87 
 
 
375 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.433704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  29.06 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf297  heat shock protein DnaJ  28.32 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.302595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  28.76 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0164  chaperone protein DnaJ  29.53 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  29.25 
 
 
388 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  27.76 
 
 
379 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  28.53 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  27.39 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  28 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3554  chaperone protein DnaJ  29.14 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.562407  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0767  chaperone protein DnaJ  26.72 
 
 
379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  25.83 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1751  chaperone protein DnaJ  29.21 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  29.01 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  28.77 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>