More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2879 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2879  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  67.72 
 
 		 255 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  59.11 
 
 		 267 aa  328  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  60.57 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  60.57 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  59.59 
 
 		 276 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  57.83 
 
 		 256 aa  314  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2619  protein serine/threonine phosphatases  56.22 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1861  protein phosphatase 2C domain-containing protein  55.06 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  55.24 
 
 		 253 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  54.62 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  45.49 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  44.68 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0136  protein serine/threonine phosphatase  36.55 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  32.76 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  31.46 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  31.67 
 
 		 304 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  31.67 
 
 		 304 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  32.78 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  33.75 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  31.67 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  33.18 
 
 		 449 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  33.2 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  34.7 
 
 		 426 aa  99  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  38.79 
 
 		 558 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0545  protein serine/threonine phosphatase  35.16 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  31.6 
 
 		 307 aa  95.5  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  30.71 
 
 		 305 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.28 
 
 		 611 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  30.16 
 
 		 386 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.28 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  32.47 
 
 		 478 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  39.18 
 
 		 567 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 		 519 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  34.91 
 
 		 462 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  33.19 
 
 		 474 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  29.44 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  30.13 
 
 		 477 aa  92  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  29.91 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  31.92 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  29.78 
 
 		 548 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  32.05 
 
 		 597 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  29.91 
 
 		 574 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  31.94 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.48 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.4 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  32.72 
 
 		 318 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  29.25 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  33.18 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  31.88 
 
 		 474 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  31.46 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  30.19 
 
 		 416 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  33.64 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  33.05 
 
 		 463 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  29.95 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  33.64 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  29.91 
 
 		 445 aa  89  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  31.8 
 
 		 466 aa  89  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.84 
 
 		 299 aa  88.6  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  34.09 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  29.91 
 
 		 394 aa  88.2  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  32.7 
 
 		 236 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  30.18 
 
 		 313 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  30.84 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.57 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  31.22 
 
 		 472 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  32.24 
 
 		 505 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  30.42 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  33.04 
 
 		 389 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3336  protein serine/threonine phosphatases  31.67 
 
 		 633 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  28.57 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  28.97 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 		 478 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.19 
 
 		 482 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  30.96 
 
 		 301 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  32.49 
 
 		 304 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3145  protein serine/threonine phosphatases  32.6 
 
 		 271 aa  85.5  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  30.37 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  33.02 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  29.96 
 
 		 258 aa  85.1  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3671  putative serine/threonine phosphatase  26.82 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  31.15 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  29.05 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  28.89 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  29.2 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1469  protein serine/threonine phosphatase  36.15 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.71 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  32.23 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  32.03 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  32.1 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.61 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3469  protein serine/threonine phosphatase  30.36 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171174  normal  0.272032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2391  protein serine/threonine phosphatase  36.65 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  27.35 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.22 
 
 		 491 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.888724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>