110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2696 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5389  acetyltransferase, GNAT family  56.34 
 
 
153 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7224  GCN5-related N-acetyltransferase  54.61 
 
 
161 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0475463  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4926  GCN5-related N-acetyltransferase  53.19 
 
 
157 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3186  GCN5-related N-acetyltransferase  49.68 
 
 
160 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230129  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5576  GCN5-related N-acetyltransferase  52.86 
 
 
151 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5940  GCN5-related N-acetyltransferase  52.86 
 
 
151 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6442  GCN5-related N-acetyltransferase  52.86 
 
 
151 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  48.95 
 
 
157 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131392  normal  0.391091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2128  GCN5-related N-acetyltransferase  52.78 
 
 
158 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2511  GCN5-related N-acetyltransferase  51.77 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.634797  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09760  acetyltransferase (GNAT) family protein  43.57 
 
 
147 aa  110  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.257332  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5431  hypothetical protein  40.97 
 
 
173 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.519598 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0198  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 
160 aa  86.3  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7108  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450507  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  34.75 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.336219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.331512 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2832  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
153 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3183  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
148 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.658111  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5800  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
280 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.476968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5064  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
149 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0793  putative acetyltransferase  23.08 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.294913  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0921  putative acetyltransferase  23.08 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.335602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4463  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  28.36 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2187  acetyltransferase  29.71 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3068  acetyltransferase  32.93 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  23.13 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4578  putative GCN5-related N-acetyltransferase (GNAT)  36.99 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140894  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
162 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1233  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.56 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262778  normal  0.168015 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.82 
 
 
183 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
259 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607994  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2933  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0253991  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12684  hypothetical protein  34.38 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.74 
 
 
304 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2187  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.56 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2083  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.56 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0325128  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3229  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.56 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2464  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.56 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2520  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.56 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1356  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.56 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0397036  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
237 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2352  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
372 aa  43.9  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425265  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
153 aa  43.9  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34088  predicted protein  36.14 
 
 
183 aa  43.9  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1934  acetyltransferase  23.74 
 
 
295 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1886  acetyltransferase  23.02 
 
 
295 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.708702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  32.67 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2609  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.56 
 
 
491 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
305 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2672  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2081  acetyltransferase  23.74 
 
 
295 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03020  predicted acetyltransferase  32.94 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2002  putative acetyltransferase  26.77 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0063  hypothetical protein  29.85 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2497  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 
350 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1945  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.77 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  23.74 
 
 
295 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
291 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2850  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
175 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5353  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.2 
 
 
166 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1364  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.98 
 
 
164 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  28.87 
 
 
848 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
226 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.77 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2076  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.77 
 
 
166 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2044  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.77 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0856  GCN5-related N-acetyltransferase  37.97 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1787  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.999117  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2063  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.77 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.660886 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2510  acetyltransferase, GNAT family  20.5 
 
 
308 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2446  acetyltransferase  22.33 
 
 
308 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.034806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  33.33 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0733  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
191 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473916  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
309 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  23.4 
 
 
312 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.367916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5386  hypothetical protein  58.06 
 
 
35 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
201 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>