142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3235 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
162 aa  323  6e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0845  GCN5-related N-acetyltransferase  52.11 
 
 
159 aa  147  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455582  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  50.35 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.757532  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  47.92 
 
 
149 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  42.38 
 
 
153 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  46.56 
 
 
166 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  44.27 
 
 
148 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4339  GCN5-related N-acetyltransferase  45.8 
 
 
147 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0386238  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  44.06 
 
 
149 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  44.7 
 
 
148 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01810  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.43 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4171  hypothetical protein  30.08 
 
 
157 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4453  hypothetical protein  29.85 
 
 
163 aa  57.8  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.767162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2137  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3786  hypothetical protein  31.82 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  32.81 
 
 
143 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4133  hypothetical protein  31.82 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
237 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0020  hypothetical protein  31.06 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4266  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0063  hypothetical protein  30.66 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0063  hypothetical protein  26.85 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3751  hypothetical protein  30.22 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4046  hypothetical protein  30.22 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0166  hypothetical protein  30.22 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0329  putative acetyltransferase  28.15 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4017  GCN5-related N-acetyltransferase  34.17 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760324 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2061  acetyltransferase  27.03 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29997  predicted protein  41.43 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0174  hypothetical protein  30.4 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  25.98 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0855  GNAT family acetyltransferase  27.27 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1583  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3872  hypothetical protein  29.5 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2073  acetyltransferase  33.33 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.539818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4927  hypothetical protein  28.78 
 
 
146 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2481  GCN5-related N-acetyltransferase  25.87 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000827608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
206 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1223  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
151 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3975  hypothetical protein  28.78 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1192  acetyltransferase  32.5 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.261009  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
168 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  25.85 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
157 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2776  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0724  acetyltransferase  23.02 
 
 
154 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.268912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.22 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
161 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195178  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
143 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  52.73 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4688  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  40.96 
 
 
368 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0630  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.99 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1253  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03400  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  28.06 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1179  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03351  hypothetical protein  28.06 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  21.09 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4578  putative GCN5-related N-acetyltransferase (GNAT)  40.79 
 
 
148 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140894  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02191  hypothetical protein  33.33 
 
 
196 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
170 aa  44.7  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.91 
 
 
181 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  39.73 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.810572  normal  0.111735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13780  acetyltransferase (GNAT) family protein  31.03 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17227  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707341  decreased coverage  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
144 aa  44.3  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1722  GCN5-related N-acetyltransferase  27.83 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00703201  hitchhiker  0.00198196 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
168 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35760  hypothetical protein  32.14 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.28006e-16  decreased coverage  1.5308899999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45980  putative acetyltransferase  32.28 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1301  acetyltransferase  37.5 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681894  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.42 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8033  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2719  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2949  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2662  GCN5-related N-acetyltransferase  27.83 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.362327  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3445  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5353  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.78 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3441  putative acetyltransferase  29.32 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5274  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  29.13 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2628  GCN5-related N-acetyltransferase  27.83 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  30.07 
 
 
547 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1945  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.71 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.88 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3423  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.679599  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  36.43 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1233  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.22 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262778  normal  0.168015 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>