26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0263 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  308  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  54 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  35.81 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  36.6 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  39.72 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  36.91 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  42.25 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  38.1 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  36.11 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  38.24 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  38.24 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0473  hypothetical protein  42.72 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0199581  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0529  glutaredoxin  39.69 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.566915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  37.31 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0749  hypothetical protein  37.14 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.110319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  50.62 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  38.3 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  34.95 
 
 		 469 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1971  glutaredoxin  46.58 
 
 		 253 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  29.05 
 
 		 309 aa  44.3  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1071  hypothetical protein  38.1 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01869  hypothetical protein  30.23 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0150  hypothetical protein  31.54 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323748  normal  0.0553337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0606  hypothetical protein  30.33 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  36.05 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  34.23 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.790547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>