41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1458 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1458  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 261 aa  543  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.158557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1330  aminoglycoside phosphotransferase  52.23 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0966  aminoglycoside phosphotransferase  36.65 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.238435  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0369  aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000170406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0973  aminoglycoside 3-phosphotransferase type IIB  30.88 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10670  aminoglycoside 3'-phosphotransferase type IIB  32.16 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2256  aminoglycoside phosphotransferase  34.12 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2951  aminoglycoside phosphotransferase  29.61 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863477  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1320  aminoglycoside phosphotransferase  29.96 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1717  aminoglycoside phosphotransferase  33.54 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2197  aminoglycoside phosphotransferase  28.77 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0392528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0195  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000752934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3721  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  29.29 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  29.06 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4099  3''-kinase  31.61 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0454  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  27.73 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0010  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  27.05 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.590749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2693  aminoglycoside phosphotransferase  29.13 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.876153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6646  3''-kinase  28 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3941  3''-kinase  28 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  hitchhiker  0.00925302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3368  aminoglycoside phosphotransferase  26.29 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5038  Kanamycin kinase  25.82 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0328553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6179  aminoglycoside phosphotransferase  26.11 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3531  aminoglycoside phosphotransferase  30.68 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1184  aminoglycoside phosphotransferase  28.09 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.775153  normal  0.354741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13851  phosphotransferase  27.54 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.612969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1464  aminoglycoside phosphotransferase  27.45 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1799  aminoglycoside phosphotransferase  25.23 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2292  aminoglycoside phosphotransferase  24.51 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168028  normal  0.166014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1990  aminoglycoside phosphotransferase  31.13 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4212  aminoglycoside phosphotransferase  27.09 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1570  aminoglycoside resistance protein A  23.16 
 
 		 302 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2669  aminoglycoside phosphotransferase  23.16 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0328052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0004  streptomycin resistance protein, StrA  23.16 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0046  streptomycin resistance protein StrA  23.16 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0085  aminoglycoside resistance protein A  23.16 
 
 		 329 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0128  aminoglycoside resistance protein A  23.16 
 
 		 267 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  28.23 
 
 		 447 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4227  aminoglycoside phosphotransferase  27.12 
 
 		 303 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0563454  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  21.68 
 
 		 443 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0064  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>