More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1256 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  70.34 
 
 		 452 aa  656    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1256  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 447 aa  920    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000664093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  65.02 
 
 		 449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0241  glucose-6-phosphate isomerase  64.35 
 
 		 449 aa  598  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000576365  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2470  glucose-6-phosphate isomerase  63.37 
 
 		 448 aa  589  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  61.21 
 
 		 449 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3003  glucose-6-phosphate isomerase  60.99 
 
 		 449 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  61.31 
 
 		 443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  61.31 
 
 		 443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  60.67 
 
 		 450 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3509  glucose-6-phosphate isomerase  60.22 
 
 		 450 aa  566  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  59.33 
 
 		 450 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  60.41 
 
 		 443 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  59.11 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  59.11 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  59.11 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  59.11 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  60.41 
 
 		 443 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  59.11 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  60.45 
 
 		 448 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  59.11 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  59.95 
 
 		 443 aa  558  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  58.89 
 
 		 450 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  59.33 
 
 		 450 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  58.89 
 
 		 450 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2549  glucose-6-phosphate isomerase  60.67 
 
 		 450 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  60.36 
 
 		 451 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  59.33 
 
 		 450 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  60.78 
 
 		 448 aa  543  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  58.3 
 
 		 449 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0355  glucose-6-phosphate isomerase  59.17 
 
 		 450 aa  538  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  57.98 
 
 		 450 aa  535  1e-151  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  56.94 
 
 		 450 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  57.21 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  53.67 
 
 		 438 aa  457  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  51.79 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  51.81 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  48.09 
 
 		 427 aa  415  1e-114  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl254  glucose-6-phosphate isomerase  48.3 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  46.33 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  42.3 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  33.02 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  33.17 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  30.05 
 
 		 479 aa  189  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  33.91 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  32.33 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  33.5 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  33.86 
 
 		 449 aa  179  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  33.58 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  30.57 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2086  glucose-6-phosphate isomerase  35.45 
 
 		 460 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732698  normal  0.0228263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  31.85 
 
 		 445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  30.24 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  31.93 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  30.54 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  31.82 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  30.39 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  30.63 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  29.22 
 
 		 441 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  31.34 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf108  glucose-6-phosphate isomerase  27.98 
 
 		 440 aa  158  1e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.621836  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  30.65 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  30.65 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  31.91 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  29.8 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  31.48 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  30.88 
 
 		 473 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  30.27 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  31.19 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  28.74 
 
 		 439 aa  143  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  30.43 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  30.3 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  28.4 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  29.79 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  30.47 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  31.42 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  27.61 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  27.51 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  27.38 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  30.08 
 
 		 422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  28.18 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1381  glucose-6-phosphate isomerase  30.4 
 
 		 552 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.142127  normal  0.933656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3708  glucose-6-phosphate isomerase  30.85 
 
 		 528 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  28.12 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  29.84 
 
 		 528 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3994  Glucose-6-phosphate isomerase  28.61 
 
 		 533 aa  103  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.878901  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  29.89 
 
 		 532 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  29.13 
 
 		 529 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  27.75 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  29.26 
 
 		 532 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  29.41 
 
 		 532 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  29.41 
 
 		 532 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  30.98 
 
 		 528 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15071  glucose-6-phosphate isomerase  28.4 
 
 		 536 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 		 527 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  29.97 
 
 		 528 aa  97.8  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>