More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0543 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  100 
 
 
282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  43.73 
 
 
281 aa  239  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  40.28 
 
 
283 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  36.92 
 
 
283 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  39.86 
 
 
290 aa  198  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  36.52 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  38.13 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  36.2 
 
 
283 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  36.2 
 
 
283 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  36.1 
 
 
283 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  35.13 
 
 
283 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  35.13 
 
 
283 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  35.13 
 
 
283 aa  188  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  35.13 
 
 
283 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  37.45 
 
 
289 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  35.25 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  35.74 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  35.13 
 
 
284 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  35.02 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  35.61 
 
 
284 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  33.69 
 
 
282 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  35.13 
 
 
284 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  34.77 
 
 
284 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  34.77 
 
 
284 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  34.77 
 
 
284 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  34.77 
 
 
284 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  34.77 
 
 
284 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  31.67 
 
 
285 aa  178  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  37.21 
 
 
270 aa  177  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  35 
 
 
290 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  34.64 
 
 
290 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  34.64 
 
 
290 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  34.29 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  32.86 
 
 
293 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  32.86 
 
 
293 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  32.5 
 
 
293 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  32.5 
 
 
293 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  34.05 
 
 
289 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  34.4 
 
 
296 aa  162  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  33.11 
 
 
304 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  35.38 
 
 
279 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  32.26 
 
 
304 aa  158  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  35.38 
 
 
279 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  34.8 
 
 
240 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  30.28 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  31.21 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  28.98 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  29.93 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  29.63 
 
 
282 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  29.96 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  30.8 
 
 
287 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  27.8 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  28.16 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.93 
 
 
293 aa  109  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0656  patatin  28.72 
 
 
373 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.52912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4925  patatin family phospholipase  28.24 
 
 
357 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4612  patatin family phospholipase  28.24 
 
 
357 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5890  phospholipase, patatin family  28.24 
 
 
357 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.547138  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4975  patatin family phospholipase  28.24 
 
 
357 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.065894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04253  predicted esterase  28.85 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463702  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3621  Patatin  28.85 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04219  hypothetical protein  28.85 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4921  phospholipase, patatin family  28.85 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3679  patatin  28.85 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.436712  hitchhiker  0.00198477 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0834  patatin family phospholipase  26.83 
 
 
422 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3501  patatin family phospholipase  26.48 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3630  patatin  26.83 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330139  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.57 
 
 
733 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0537  patatin  32.12 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.871804  hitchhiker  0.00848516 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2256  Patatin  27.34 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4884  phospholipase, patatin family  27.34 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4817  patatin  27.34 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4971  patatin  27.34 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4919  patatin  27.34 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  29.61 
 
 
349 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4978  patatin  27.34 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  30.73 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.7 
 
 
727 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  29.15 
 
 
751 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  29.15 
 
 
728 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  27.39 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  24.15 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  28.57 
 
 
638 aa  72.4  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  28.33 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  28.33 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  28.33 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  29.15 
 
 
728 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  26.5 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  27.9 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  25.86 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.6 
 
 
383 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  27.47 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  26.47 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  26.69 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  26.69 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  25.43 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  26.69 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  27.54 
 
 
474 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  27.12 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  26.69 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>