More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0153 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0153  fumarase  100 
 
 		 476 aa  974    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  54.82 
 
 		 472 aa  481  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  49.33 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  49.89 
 
 		 485 aa  435  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  49.02 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  50.89 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  48.79 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  47.93 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  48.25 
 
 		 482 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  48.03 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  48.15 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  47.6 
 
 		 483 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  48.47 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  48.58 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  49.78 
 
 		 481 aa  418  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  48.25 
 
 		 483 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  46.56 
 
 		 479 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  47.38 
 
 		 483 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  47.92 
 
 		 484 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  45.53 
 
 		 571 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  46.76 
 
 		 477 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  48.37 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  47.6 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 470 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  46.34 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  46.76 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  46.98 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  46.34 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  50.44 
 
 		 475 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  46.19 
 
 		 479 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  46.56 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  46.41 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  46.34 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  46.19 
 
 		 479 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  46.76 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  47.71 
 
 		 485 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  47.28 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  46.76 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  49.01 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  46.34 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  46.53 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  45.11 
 
 		 568 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  46.72 
 
 		 475 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  47.28 
 
 		 478 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  46.76 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  47.28 
 
 		 474 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  46.76 
 
 		 477 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  49.02 
 
 		 471 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  47.28 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  49.12 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  46.72 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  46.34 
 
 		 479 aa  412  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  46.76 
 
 		 477 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  46.53 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  45.18 
 
 		 560 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  46.53 
 
 		 477 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  47.28 
 
 		 478 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  46.07 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  49.55 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  46.72 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3747  aspartate ammonia-lyase  45.97 
 
 		 479 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1105  aspartate ammonia-lyase  46.36 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  46.84 
 
 		 478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  46.12 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  45.42 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  45.87 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  47.95 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  49.22 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  47.95 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  46.54 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  47.68 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.29 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  47.01 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  46.27 
 
 		 474 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  47.38 
 
 		 482 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  45.33 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  45.92 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  47.9 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  46.62 
 
 		 475 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  47.73 
 
 		 468 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  48.69 
 
 		 475 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  46.19 
 
 		 478 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  46.56 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  46.56 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  46.56 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  46.19 
 
 		 478 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  47.9 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  46.19 
 
 		 478 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  46.56 
 
 		 479 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  47.33 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  46.56 
 
 		 476 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  44.76 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  46.12 
 
 		 476 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  48.85 
 
 		 521 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1116  putative aspartate ammonia-lyase  46.54 
 
 		 466 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  46.12 
 
 		 476 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  46.22 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  48.8 
 
 		 468 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  48.23 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>