55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1945 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1945  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  100 
 
 		 453 aa  899    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.645504  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0360  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  38.82 
 
 		 406 aa  249  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1533  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  33.41 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.12 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  24.94 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  25.48 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  24.32 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0228  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  21.81 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  25.22 
 
 		 432 aa  90.1  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  24.75 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  25.99 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  25.99 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  23.58 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  23.78 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  25.43 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  24.12 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  23.96 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  24.12 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  29.61 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  23.96 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  26.13 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  25 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  26.9 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  25.42 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  26.02 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  22.96 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.49 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  25.14 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  25.14 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  24.93 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  23.54 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  22.86 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1116  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  29.47 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.139132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  25.65 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  23.02 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.7 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.82 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  22.97 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  29.46 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.15 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  22.53 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  23.1 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  26 
 
 		 439 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1384  putative ABC transporter permease  24.69 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.378059  normal  0.872307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0905  Na+ efflux pump ABC transporter permease-like protein  25.25 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.17496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  21.97 
 
 		 433 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  21.72 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0582  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  25.49 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.94 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2712  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  28.09 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0219  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  24.29 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.444112  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  25.31 
 
 		 360 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0836  ABC transporter permease  23.96 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.36 
 
 		 457 aa  46.6  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>