60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24000 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24000  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation  100 
 
 		 129 aa  231  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517865  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  47.37 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  44.05 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  35.37 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0494  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0931  camphor resistance CrcB protein  37.07 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.683731  hitchhiker  0.00174486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  33.63 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  30.93 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0339  Camphor resistance CrcB protein  47.95 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  37.27 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  29.6 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  30.93 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  34.09 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  36.71 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  37.04 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  44.87 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  31.18 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  37.97 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  44.87 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  32.93 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  32.93 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  30.23 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  33.01 
 
 		 125 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  33.75 
 
 		 122 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  30.23 
 
 		 126 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  39.74 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.24 
 
 		 124 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  41.56 
 
 		 119 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  40.96 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  32.14 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  40.96 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  37.97 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  41.77 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40.79 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  44 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40.79 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  33.75 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  41.33 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  37.97 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  37.97 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  36.71 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  36.26 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  40 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  36.7 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  38.75 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.22 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0519  Camphor resistance CrcB protein  40 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  37.21 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  36.26 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 129 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>