30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22110 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22110  predicted metal-dependent membrane protease  100 
 
 		 400 aa  789    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.149179 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07080  CAAX amino terminal protease family  41.92 
 
 		 334 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.541158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0509  hypothetical protein  31.48 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3335  abortive infection protein  33.64 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0128461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4058  Abortive infection protein  36.2 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15680  CAAX amino terminal protease family  30.58 
 
 		 339 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1810  Abortive infection protein  31.73 
 
 		 347 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0409959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3886  Abortive infection protein  26.05 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1193  Abortive infection protein  29.73 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1813  Abortive infection protein  33.77 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  decreased coverage  0.0023677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4288  Abortive infection protein  32.73 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  31.5 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02420  CAAX amino terminal protease family  33.92 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5416  Abortive infection protein  36.08 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0269  Abortive infection protein  32.64 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0825  Abortive infection protein  30.17 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1776  Abortive infection protein  30.77 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  40.62 
 
 		 2914 aa  51.6  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4016  abortive infection protein  33.02 
 
 		 293 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0061  abortive infection protein  32.65 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.881331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08301  hypothetical protein  31.43 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 140 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  33.96 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  28.57 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  28.57 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  41.75 
 
 		 985 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  24.7 
 
 		 237 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2471  Abortive infection protein  27.78 
 
 		 217 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0788  hypothetical protein  23.79 
 
 		 265 aa  43.1  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  29.29 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>