More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19370 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  100 
 
 
440 aa  858    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  60.48 
 
 
431 aa  478  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  63.31 
 
 
435 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  62.47 
 
 
427 aa  475  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  62.56 
 
 
430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  57.72 
 
 
427 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  58.39 
 
 
435 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  56.8 
 
 
427 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  61.46 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  53.98 
 
 
424 aa  435  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  52.77 
 
 
422 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  57.14 
 
 
429 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  54.46 
 
 
454 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  54.33 
 
 
412 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  54.65 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  54.12 
 
 
445 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  53.25 
 
 
402 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  51.08 
 
 
426 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  47.73 
 
 
474 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  50.23 
 
 
432 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  50.12 
 
 
427 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0802  MgtE intracellular region  51.68 
 
 
416 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  50 
 
 
428 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  50.48 
 
 
447 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  50.11 
 
 
431 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  50.12 
 
 
431 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  50.12 
 
 
431 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  50.47 
 
 
438 aa  364  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  50.24 
 
 
417 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  49.18 
 
 
435 aa  352  7e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  48.25 
 
 
431 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1195  MgtE intracellular region  47.09 
 
 
427 aa  342  5e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  34.37 
 
 
421 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  29.76 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  30.64 
 
 
430 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  26.97 
 
 
433 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  29.15 
 
 
420 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  33.42 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  35.68 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  36.73 
 
 
453 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  30.15 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  27.57 
 
 
625 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  26.89 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  26.89 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  27.31 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  33.08 
 
 
446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  35.24 
 
 
452 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  29.91 
 
 
417 aa  120  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  34.69 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.21 
 
 
450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  33.48 
 
 
446 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  33.08 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  29.71 
 
 
442 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  35.86 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  34.86 
 
 
460 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  32.89 
 
 
542 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  32.68 
 
 
465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  31.15 
 
 
454 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  29.88 
 
 
445 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  31.7 
 
 
450 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  30.74 
 
 
454 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  30.74 
 
 
454 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0595  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
418 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297001  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  30.36 
 
 
449 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  30.33 
 
 
454 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  28.54 
 
 
430 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  28.4 
 
 
412 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  28.69 
 
 
461 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  30.74 
 
 
454 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  28.69 
 
 
461 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  31.25 
 
 
468 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  31.95 
 
 
452 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  30.28 
 
 
481 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  23.8 
 
 
425 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  30.17 
 
 
454 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  30.17 
 
 
454 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  32.34 
 
 
453 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  30.19 
 
 
462 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  31.23 
 
 
468 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  30.04 
 
 
445 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  29.75 
 
 
454 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  28.24 
 
 
450 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  31.89 
 
 
471 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  30.19 
 
 
462 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  29.75 
 
 
454 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  32.76 
 
 
453 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  32.4 
 
 
486 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl217  Mg/Co/Ni transporter  25.71 
 
 
468 aa  100  4e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  30.4 
 
 
454 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  29.64 
 
 
463 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  31.2 
 
 
468 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  28.08 
 
 
454 aa  100  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  32.54 
 
 
469 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  28.94 
 
 
466 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  38.43 
 
 
467 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  30.45 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  27.43 
 
 
449 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  32.54 
 
 
469 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  28.95 
 
 
480 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  28.57 
 
 
480 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>