290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7400 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  853    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0595  CBS domain-containing protein  40 
 
 
418 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297001  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  34.96 
 
 
413 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  31.48 
 
 
421 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  28.71 
 
 
625 aa  149  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  32.11 
 
 
445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  31.08 
 
 
429 aa  143  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  29.93 
 
 
454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  29.61 
 
 
459 aa  136  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  29.82 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  28.82 
 
 
402 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  28.33 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  29.17 
 
 
424 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  28.43 
 
 
428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  24.76 
 
 
426 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  31.31 
 
 
427 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  25.56 
 
 
430 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  30.83 
 
 
432 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  30.58 
 
 
427 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  28.67 
 
 
474 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  30.75 
 
 
412 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  30.58 
 
 
431 aa  123  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  29.98 
 
 
426 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0802  MgtE intracellular region  31.58 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  30.77 
 
 
431 aa  119  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  30.77 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  30.19 
 
 
431 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  30.19 
 
 
417 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  25.52 
 
 
417 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  24.52 
 
 
420 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  30.19 
 
 
431 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  29.66 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  29.85 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  24.02 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  23.84 
 
 
423 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  30.61 
 
 
435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  29.73 
 
 
451 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  23.6 
 
 
423 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  34 
 
 
460 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  30.05 
 
 
435 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  33.85 
 
 
460 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  34.92 
 
 
460 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  31.39 
 
 
463 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  31.58 
 
 
442 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  28.47 
 
 
440 aa  103  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  28.34 
 
 
427 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  29.1 
 
 
431 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  27.35 
 
 
449 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  33.03 
 
 
454 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1195  MgtE intracellular region  28.68 
 
 
427 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  28.68 
 
 
430 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  30.33 
 
 
486 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  27.49 
 
 
453 aa  99.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  29.66 
 
 
458 aa  99.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  30.92 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  29.69 
 
 
468 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  32.46 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  28.32 
 
 
542 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  28.7 
 
 
466 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  30.45 
 
 
460 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  32.54 
 
 
460 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  26.96 
 
 
412 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  30.95 
 
 
460 aa  96.7  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  32 
 
 
460 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  29.12 
 
 
486 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  26.47 
 
 
443 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  30.57 
 
 
449 aa  94.4  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  28.7 
 
 
462 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  30.36 
 
 
462 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  30.68 
 
 
453 aa  93.2  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  26.85 
 
 
449 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  30.25 
 
 
450 aa  92.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  25.53 
 
 
462 aa  90.9  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  29.46 
 
 
469 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  23.08 
 
 
444 aa  90.9  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  29.46 
 
 
469 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  31.67 
 
 
465 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  28.8 
 
 
430 aa  90.5  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  29.65 
 
 
452 aa  90.1  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  21.8 
 
 
425 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  29.65 
 
 
472 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  30.04 
 
 
452 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  29.27 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  25.73 
 
 
450 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  28.4 
 
 
462 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  28.51 
 
 
461 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  32.16 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  29.72 
 
 
452 aa  88.2  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  29.65 
 
 
463 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  30.32 
 
 
449 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  29.32 
 
 
454 aa  87  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33110  Mg2+ transporter MgtE  31.38 
 
 
446 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.237395  normal  0.754036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  32.11 
 
 
455 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  28.51 
 
 
451 aa  86.7  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  28.28 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  27.5 
 
 
463 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  28.09 
 
 
463 aa  86.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  29.15 
 
 
476 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  29.87 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  27.94 
 
 
473 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>