More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0475 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  100 
 
 		 413 aa  800    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0595  CBS domain-containing protein  39.36 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297001  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  34.96 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  32.05 
 
 		 421 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  33.01 
 
 		 454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  33.5 
 
 		 445 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  30.7 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  33.17 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  32.84 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  33.33 
 
 		 429 aa  143  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  31.48 
 
 		 474 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  31.14 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  29.86 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  30.8 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0802  MgtE intracellular region  32.18 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  31.3 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  34.65 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  31.18 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 		 423 aa  133  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  31.18 
 
 		 431 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  31.18 
 
 		 431 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  32.26 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  29.33 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  24.94 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  32.25 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  25.44 
 
 		 423 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  29.98 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  24.03 
 
 		 433 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  30.39 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  30.77 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  26.72 
 
 		 459 aa  126  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  30.66 
 
 		 412 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  25.62 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  26.37 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  30.6 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  31.13 
 
 		 427 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  30.37 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1195  MgtE intracellular region  30.14 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  29.97 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  32.89 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  30.83 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  32.11 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  28.85 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  25.24 
 
 		 625 aa  112  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  30 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  32.29 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  32.29 
 
 		 461 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  31.02 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  34.92 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  31.43 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  31.23 
 
 		 463 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  29.28 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  25.5 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  33.04 
 
 		 473 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  24.22 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  31.84 
 
 		 473 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  33.48 
 
 		 472 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  31.98 
 
 		 542 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  33.93 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  32.59 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  33.19 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  33.04 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  32.58 
 
 		 470 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  30.45 
 
 		 442 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  30.09 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  27.88 
 
 		 461 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  31.48 
 
 		 460 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5759  magnesium transporter  30.64 
 
 		 450 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  29.07 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  30.8 
 
 		 473 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  26.14 
 
 		 445 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  32.58 
 
 		 450 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  31.2 
 
 		 473 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  34.35 
 
 		 453 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  31.7 
 
 		 473 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  31.53 
 
 		 449 aa  93.2  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  34.22 
 
 		 453 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  33.19 
 
 		 471 aa  93.2  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  31.44 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  29.2 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3316  magnesium transporter  35.94 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.685446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  29.73 
 
 		 482 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  27.23 
 
 		 454 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  33.64 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  32.31 
 
 		 473 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  27.07 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  28.12 
 
 		 458 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  28.11 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  31.38 
 
 		 454 aa  90.9  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  32.8 
 
 		 449 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  31.86 
 
 		 444 aa  90.1  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0092  MgtE intracellular region  23.7 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0286357 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0294  magnesium transporter  27.15 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  25.93 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  27.88 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  27.88 
 
 		 471 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  30.16 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  26.11 
 
 		 456 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  28 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  32.43 
 
 		 456 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>